Elaboración de un Corredor Endémico, Monografías, Ensayos de Bioestadística

¡Descarga Elaboración de un Corredor Endémico y más Monografías, Ensayos en PDF de Bioestadística solo en Docsity! Corredores o canales endémicos y su elaboración usando planillas de cálculo Marcelo Bortman Probablemente la más corta y simple definición de epidemia la ha dado Benenson quien la define como “La aparición de casos de una enfermedad en evidente exceso de lo esperado” [1]. Last, en “A Dictionary of Epidemiology” [2] agrega a la definición el concepto de espacio, “en una comunidad”, y la extiende a otros eventos relacionados con la salud, manteniendo la idea de “un evidente exceso”. En ambas definiciones está implícito una comparación entre el número de casos detectados y una cifra “normal de casos”. Esa cifra “normal” dependerá obviamente de la población, del área geográfica y del período de tiempo que se considere. Este último punto es especialmente importante para aquellas enfermedades agudas en las que la estacionalidad juega un rol importante. La palabra epidemia tiene un “ aura pestilente” que hace que muchos prefieran usar en su lugar el término “brote” para referirse a los excesos de casos de una enfermedad o daño. Si bien originalmente la definición de epidemia fue pensada en las enfermedades transmisibles, su uso es totalmente compatible con las no transmisibles y es así como por ejemplo durante los fines de semana largos (con viernes o lunes feriados) se producen verdaderos “brotes” o epidemias de accidentes de transito. Johan Giesecke destaca que no sólo el número de casos, (tiempo y lugar), debe ser considerado, y que una distribución poblacional particular, (tiempo, lugar y persona) puede estar evidenciando una número de casos mayor a lo esperado para ese grupo poblacional específico, (mujeres, trabajadores de una particular industria, con un característico estilo de vida, etc) [3] Teniendo en cuenta lo hasta aquí expuesto, a la hora de hacer vigilancia epidemiológica en una población, será fundamental conocer “cuanto es endémico”. Esto es, cual es la incidencia histórica de la enfermedad para dicha población o grupo y para ese “momento” del año. Es aquí entonces donde se hace necesario la preparación de corredores o canales endémicos en los que la incidencia actual pueda ser graficada sobre la incidencia histórica y de esta forma detectar precozmente cifras anormalmente altas (o bajas) de casos de la enfermedad en estudio. Ya en 1970 los Dres Héctor Boffi Borggero y Carlos Alvarez Herrera describen varios métodos para la realización de corredores endémicos [4]. En todos ellos a partir de una serie de casos de un período de 5 a 7 años, se trata de obtener una medida central y un rango de fluctuación normal de la incidencia para cada uno de los meses. El más sencillo de estos métodos consistía en graficar el número máximo y mínimo de casos denunciados en cada mes, generando así una “banda endémica” con un área inferior de seguridad y una superior o epidémica. Un poco más complejo es el método de la mediana y los cuartiles, que genera cuatro zonas: una debajo del cuartil inferior o zona de éxito, una entre en cuartil inferior y la mediana o zona de seguridad, una entre la mediana y el cuartil superior o zona de alerta y una por arriba del cuartil superior o zona epidémica. Los más complicados modelos eran el de los mínimos cuadrados, (que analizaba las tendencias lineales de cada años), y el de la media aritmética y desvíos estándar que requerían contar con personal con considerables conocimientos en estadística para su realización. Estos últimos modelos también cuentan con las cuatro zonas ya descriptas y que pueden verse el gráfico nº 1. Agrupamiento de entidades o patologías: Cuando la incidencia lo permita será útil realizar corredores independientes para cada patología y sus subgrupos, por ejemplo diarreas por grupos etáreos, o por agentes etiológicos. En el otro extremo, en poblaciones pequeñas, se podría mantener agrupadas las entidades con una similar forma de transmisión vigilando así ya no el comportamiento de un germen o una entidad, sino el de una vía de transmisión. Poblaciones: De forma similar que en el caso anterior mantener la información y los corredores endémicos desagregados por pequeñas áreas geográficas favorecerá la posibilidad de detectar pequeños brotes locales que resultarían diluidos en cifras acumuladas de regiones más amplias. Pero este nivel de desagregación deberá equilibrarse con el incremento de la imprecisión de los resultados. Cabe destacar aquí que en ciertas circunstancias es justamente la vigilancia sobre poblaciones más grandes y su consiguiente aumento de precisión lo que permite la detección de un brote. Así, podrá ser que en varias áreas se genere un número de casos mayor que la media pero sin ingresar en la zona de alarma, mientras que sobre el corredor endémico de la región este “ligero” aumento en los niveles locales resulte en un “notable” incremento en la región. Otro punto a tener en cuenta, son los cambios que sufren las poblaciones en el número de habitantes a través de los años. Por esta razón no será adecuado trabajar los datos como casos. Siempre que se pueda, se deberá contar con cifras de población que posibiliten la realización de los corredores usando tasas de incidencia. De igual manera, si se consideran patologías según ciertos grupos etáreos, se deberá trabajar con tasas de incidencia especificas para esos grupos, debiéndose contar entonces con la información de habitantes por grupos etáreos y para cada año de las series incluidas. Longitud de las series e intervalos de tiempo: Usualmente los corredores se construyen con series de casos de 5 a 7 años. Se puede presuponer que al incrementarse el número de años, se mejorará el modelo de predicción, pero deberá tenerse en cuenta que si se toman series muy largas es probable que tanto las condiciones que mantienen la endemia como los criterios diagnóstico y los mecanismo de denuncia y registro hayan cambiado. Esto no es igual para todas las entidades, pero en líneas generales si se toma una serie de 15 años, difícilmente las condiciones de hace 15 años puedan compararse con las actuales. Este tipo de cambios deberán ser también tenidos en cuenta aún cuando se tomen pocos años. Por ejemplo, si recientemente se han realizado substanciales mejoras en la red cloacal de una localidad, la incidencia de enfermedades de transmisión fecal-oral debería ser menor a la “pronosticada” por el corredor endémico. En cuanto a los intervalos de tiempo, sería siempre deseable realizar corredores por semanas epidemiológicas. Pero ante bajas incidencias, se deberá utilizar períodos mayores, (2 o 4 semanas) los que tenderá a estabilizar las fluctuaciones debidas al azar. La desventaja de usar períodos de 2 a 4 semanas es que disminuyen la posibilidad de detección precoz de los brotes y de las consiguientes acciones de control. Selección del programa de computación para hacer el corredor Si bien existe la posibilidad de desarrollar programas específicos para la realización de corredores endémicos, éstos trabajarían a manera de “caja negra”. Los datos serían ingresados en un extremo de la “caja”, y los corredores “saldrían” por el otro extremo distanciando a quien hace vigilancia epidemiológica de todo el proceso de su elaboración. Por esta razón y teniendo en cuenta el extenso uso de las planillas de cálculo y las facilidades que éstos programas tienen para realizar cálculos y gráficos, este tipo de utilitarios resultan los más aptos para esta tarea. Las planillas de cálculo a las que aquí se hará referencia son: QPro versión 4.0 o 5.0 y Microsoft Excel versión 5.0 y 97 y obviamente será conveniente tener algún grado de experiencia en el uso de alguno de estos programas. Método de las medias geométricas de las tasas El método de la media geométrica de las tasas y sus intervalos de confianza es desde el punto de estadístico uno de los más sólidos. El detalle de este método podrá resultar un poco técnico, pero será útil su lectura. Como ya se ha mencionado, el uso de tasas en lugar de casos, ajusta las distorsiones que generan los cambios en los tamaños de las poblaciones a través de los años. Media geométrica Teniendo en cuenta que las 5 a 7 tasas con las que hay que calcular un valor central, difícilmente tengan una distribución normal, el uso de la media aritmética no sería lo más adecuado. En cambio la media geométrica es una medida de tendencia central apropiada para distribuciones de valores asimétricas o no normales y esta especialmente indicada para distribuciones con aislados valores altos o muy altos. Esto último hace que eventuales cifras muy altas producto de alguna epidemia ocurrida durante la serie de tiempo incluida en la construcción del corredor se diluyan y no distorsionen la incidencia histórica. Para el cálculo de la media geométrica se procede a realizar una transformación logarítmica de los valores. µ = log x Donde x es el valor inicial, y µ el valor transformado. IC 95% = media ± t . de / √ n Donde n es el número de años considerados en el cálculo, de el desvío estándar y t es un valor que sale de la tabla de distribución de t y que varia en función de n. Valores de t para IC 95% según años incluidos en las series Número de años Valor de t para IC 95% Número de años Valor de t para IC 95% 3 4.30 8 2.36 4 3.18 9 2.31 5 2.78 10 2.26 6 2.57 11 2.23 7 2.45 12 2.20 Por ejemplo, para calcular el intervalo de confianza del 95% de la media geométrica de las tasas de incidencia de sarampión del período 1983 - 1989, se deberá realizar el siguiente cálculo: IC 95% = 1,96 ± 2,45 x 1,77 / √ 7 = 1.96 ± 1.639 = 0,32 a 3.6 Donde 1.96 y 1.77 son la media y el DE en escala logarítmica, 7 el n (7 años) y 2.45 es el valor de t para un n de 7. Al transformar los resultados a la escala original: Media geométrica de la tasa de incidencia = 7,10 por 100000 IC 95% de 1,38 a 36,6 Nótese que los intervalos de confianza superior e inferior no son simétricos, sin embargo la razón entre el límite superior y la media y entre la media y el límite inferior si lo son: (36,6 / 7,10 = 7,10 / 1,38 ) Elaboración en etapas Para la elaboración del corredor endémico en una planilla de cálculo, será necesario realizar una serie de tablas y cálculos en varias etapas. 1ra ETAPA. Ingreso de los datos. El primer paso será establecer un bloque en donde se ingresarán los casos detectados por años y períodos. Por ejemplo el bloque 1 [A1 a BB10] con 52 semanas en las columnas y los años en las filas ha sido preparado para ingresar los casos de 1990 a 1998. Nótese que se ha preparado la última columna (BB) para la colocar en ella las poblaciones en cada año. Bloque 1: Casos por semana y años, y población por años A B C D E AX AY AZ BA BB 1 Año \ Sem 1 2 3 4 49 50 51 52 Población 2 1990 3 1991 4 1992 5 1993 6 1994 7 1995 8 1996 9 1997 10 11 2da ETAPA. Cálculo de las tasas. El segundo paso será calcular las tasas de incidencia semanal y sumarle 1 a cada una de las tasas para permitir calcular la media geométrica en caso de existir tasas igual a 0. Para esto se preparará un bloque similar debajo del anterior (Bloque 2 [A15 a BA24]) y en cada celda del bloque se ingresará la fórmula correspondiente. La forma más rápida de hacer esto será ingresar la formula en la casilla B16 y copiar esta fórmula en las restantes casillas. La formula en la casilla B16 será: ((+B2 / $BB2 * 100000) + 1). Donde B2 es el numero de casos de la semana 1 del año 1990, y BB2 la población en 1990. El signo $ antes de BB permitirá que al copiar esta fórmula en otras casillas se continúe usando la columna BB para obtener las poblaciones. Después de copiar las fórmulas habrá que verificar este procedimiento y confirmar que las fórmulas se han copiado adecuadamente, fijarse por ejemplo, que la casilla D19 contenga la fórmula ((+D5 / $BB5 * 100000) + 1). Bloque 2: Cálculo de tasas de incidencia semanal más 1. D19: ((+D5 / $BB5 * 100000) + 1) A B C D E AX AY AZ BA 15 Año \ Sem 1 2 3 4 49 50 51 52 16 1990 17 1991 18 1992 19 1993 20 1994 3ra ETAPA. Transformación logarítmica de las tasas. Para transformar las tasas en escala logarítmica se utilizará un tercer bloque similar al anterior (Bloque 3) y se usará la función LN(x), donde x es la casilla correspondiente del bloque anterior. Bloque 3: Transformación logarítmica de las tasas. D19:(@LN(D19)) A B C D E AX AY AZ BA 27 Año \ Sem 1 2 3 4 49 50 51 52 28 1990 @Ln(b16) 29 1991 30 1992 31 1993 32 1994 Gráfico con Microsoft Excel Se marca el bloque (A52..BA54) y desde Insertar-Gráfico-en esta hoja, se ingresa al asistente para gráficos. Se selecciona un gráfico de áreas tipo 1 y se continua con el asistente hasta terminar. Como al trabajar con QPro, se podrá luego agregar títulos modificar los colores o tramas de las series, etc. antes de imprimir (Gráfico nº 2). GRAFICO Nº 2: Corredor endémico de diarreas en mayores de 5 años. Rincón de los Sauces - años 1990 a 1996 -5 0 5 10 15 20 25 30 35 1 4 7 10 13 16 19 22 25 28 31 34 37 40 43 46 49 52 Semanas C as os CORREDOR ENDEMICO ACUMULATIVO Tal como se comentó anteriormente, una alternativa para realizar corredores endémicos para entidades endémicas pero de baja incidencia, es utilizar la incidencia acumulada en lugar de la incidencia semanal. De esta forma, se evitará que el corredor presente una imagen muy dentada. Los gráficos 3 y 4 muestran respectivamente el corredor endémico y el corredor endémico acumulativo para meningitis bacteriana en la provincia del Neuquén del período 1990 a 1996. En ambos corredores se graficó también la incidencia del año 1997 hasta la semana 31 como una linea negra. Como puede verse, la vigilancia de la incidencia actual se hace más fácil en el gráfico 4 de incidencia acumulada. GRAFICO Nº 3: Corredor endémico de Meningitis Bacterianas. Provincia del Neuquén - años 1990 a 1996 e incidencia 1997 (sem 31) -1 0 1 2 3 4 5 6 7 1 5 9 13 17 21 25 29 33 37 41 45 49 Semanas C as os GRAFICO Nº 4: Corredor endémico acumulado de Meningitis Bacterianas. Provincia del Neuquén - años 1990 a 1996 e incidencia 1997 (sem 31) 0 10 20 30 40 50 60 70 1 5 9 13 17 21 25 29 33 37 41 45 49Semanas C as os Para realizar corredores con incidencia acumulada, bastará con introducir la incidencia acumulada semanal en lugar de la incidencia semanal, o incluir un bloque que acumule la incidencia a partir de los datos de incidencia semanal. REFERENCIAS 1. Benenson AS (de). Control of Communicable Diseases in Man, 15th edition. Washington D C: American Public Health Association, 1990. 2. Last J M. A Dictionary of Epidemiology, 2nd Edition. Oxford; Oxford University Press, 1995. 3. Giesecke, J. Modern Infectious Disease Epidemiology. Oxford University Press, Inc., New York, 1994. 4. Hector Boffi Boggero, Carlos Alvarez Herrera. Contribución al estudio de las enfermedades transmisibles mediante el uso de algunos métodos estadísticos. Salud Argentina Nº1, Ministerio de Bienestar Social, Secretaría de Estado de Salud Pública, 1970. 5. Kirkwood B. Essentials of Medical Statistics. Blackwell Science 1988. Para obtener una copia de los archivos con las planillas para realizar los corredores endémicos pueden ser solicitados por correo electrónico a Bortman@altavista.net