¡Descarga Retrotransposons Semejantes a Retrovirus: Estructura y Funcionamiento - Prof. 1965 y más Apuntes en PDF de Genética solo en Docsity! TEMA-13 RETROTRANSPOSONS SEMBLANTS A RETROVIRUS LTR = provirus (no genoma de RNA, només un cop integrats en el genoma) Tenim - En el llevat hi ha uns transposons, que tenen LTR-GAG-POL-LTR - En Drosophila LTR-GAG-POL-LTR En els dos casos em falta env (que era el que em permetia sortir). Fixa’t que no hi ha env En aquesta unitat parlarem dels retrotransposons, els quals són elements genètics mòbils, els quals es poden integrar al genoma a un gran nombre de llocs diferents. El retrotransposons es mobilitzen via RNA, és a dir, que depenen de la transcripció inversa per a la transposició. La RT genera una copia de DNA a partir del producte de transcripció de l’element (el seu RNA) i és aquesta còpia de DNA la que s’integra en una nova localització genètica. Però com veurem, els retrotransposons són uns elements molt freqüents en el genoma eucariota. Segons la seva estructura es classifiquen en dos grans grups. 1. Els que tenen elements semblants als retrovirus (amb LTR, repeticions terminals llargues) = Retrotransposons semblants a retrovirus 2. Els que no tenen extrems LTR = Retrotransposons NO semblants a retrovirus RETROSTRASPOSONTS SEMBLANTS A RETROVIRUS El LTR, tenia unes repeticions terminals altres que se’ls hi va dir delta, i en aquell moment, es va seqüenciar, i es va buscar si hi havia alguna pauta de lectura, buscant si hi havia codons d’estop. (Quan un DNA no tinc ni idea del que fa, busco si hi ha una pauta llarga o oberta, perquè tinc molts codons d’aminoàcids seguits). Quan et trobes una seqüència sense codons stop, vol dir que tenim una pauta de lectura oberta “ORF”, hi ha un possible gen. Doncs en aquests casos hi havia dos ORF. Quan desprès vam agafar aquestes seqüències, ens vam torbar en que Tya té homologia amb GAG, i que Tyb té homologia amb POL. Per tant, ens ha de quedar clar que els retrotransposons semblants a retrovirus tenen regions codificants homòlogues a dues de les tres regions codificants del retrovirus; són les que permeten sintetitzar els enzims del seu cicle biològic. L’únic que no tenen són les regions ENV, que si recordem bé, eren aquelles seqüències que codificaven per ala formació de proteïnes de l’embolcall extern. Aquí, a la dreta veiem la representació esquemàtica dels elements Ty, típics del llevat. Són un tipus de retortransposó eucariota que es troba en organismes com el llevat. Aquest element, té un gran nombre de característiques que són úniques. De fet, sembla un retrovirus molt primitiu. En el llevat, es poden trobar habitualment unes 35 copies d’elements Ty al llarg del genoma haploide. Aleshores, d’acord amb el que acabem de veure, els retrotransposons es mobilitzen seguin un cicle que recorda el d’un retrovirus, però de manera endògena, sempre entre el citoplasma i el nucli de la mateixa cèl·lula. No tenen la capacitat d’infecció d’una altra cèl·lula, ja que no tenen ENV, i no poden generar els elements de membrana que els permetrien marxar. proteïnes hem vist que es formaven, doncs hem vist que era capaç de donar totes les proteïnes típiques d’un retrovirus excepte aquelles que formaven la recoberta de la membrana. Gràcies a això, hem dit que, aleshores totes les proteïnes que es formen són incapaces de que els retrotroansposons, puguin emergir a l’espai extracel·lular per gemmació de la membrana cel·lular, tanmateix, si que poden integrar-se altra forma en el genoma de les cèl·lula hoste. Si hi ha una transcripció molt potent de Ty, es vna poder veure una cirtoplasma ple d LVP? No estana a la mateixa pauta ORF A i ORFB (no entra) El GRET1 seria una transposó semblant a retrovirus, que per reconvenció, en poden deixar el LTR sol. En el raïm, també hi ha transposons tipus retrovirus. Per tant n’hem vist: - Llevat - Drosphila - RAÏM També, hem dit que els millor caracteritzats són els Ty, propis del llevat i el elements copia de Drosophila. Però aquests transposons, estan extensos en molts altres tipus . L’element còpia de la Drosophila, està format per 7 famílies amb mides diferents. Les LTR tenen mides de 236 pb i en aquest cas, les LTR tenen seqüències invertides. OJO! En els elements que tenen LTRs, es forma primer la doble cadena de DNA, aleshores sla integrassa, talla els extrems 3’ i integra els fragments.
