Scarica Il ciclo dell'acido citrico - 9 e più Slide in PDF di Fenomeni Fisico Chimici Nei Sistemi Biologici solo su Docsity! Il ciclo dell’acido citrico
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Funzioni del ciclo di Krebs
Gli intermedi del ciclo dell'acido citrico sono i precursori della biosintesi
di altri composti.
Es:
Ossalacetato può essere usato per la sintesi di glucosio nella gluconeogenesi o
nella biosintesi di AA (aspartato).
Il citrato può entrare nella biosintesi di acidi grassi o del colesterolo
l'a-chetoglutarrato => AA (glutammato)
L'ossidazione di un gruppo Ac- a 2 CO, richiede il trasferimento di quattro coppie
di elettroni. 3 coppie vengono usate per la formazione di 3 NADH. La quarta va a
formare FADH,,
La maggior parte dell'energia prodotta viene conservata nei coenzimi ridotti.
Altra viene recuperata nel GTP.
CHa- C-t007
+— CoASH + NAD+
pyruvate dehydrogenase
CO + NADH
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Î
latta
mart
|
"CO
Q-Keloglutarate
nat
Sintesi dell'Ac-CoA da piruvato
L'Ac-CoA viene formato dalla decarbossilazione ossidativa del piruvato tramite
il complesso multienzimatico piruvato deidrogenasi formato da 3 enzimi
El Pimvato deidrogenasi, E2 diidrolipoiltransacetilasi, E3 diidrolipoildeidrogenasi
e 5 coenzimi (TPP, Lipoamide, CoA, NAD*, FAD) [Tab 16.1]
Il coordinamento fra i tre enzimi è promosso dall'E2 nel quale una molecola di
acido lipoico è legato alla lys dell'enzima formando un lungo braccio (14A) di
lipoîl-lisina che fa oscillare il gruppo disolfuro fra Eldove raccoglie un gruppo
idrossietile al sito attivo di E2 (formazione di Ac-CoA) e successivamente ad E3
dove viene riossidato il gruppo disolfuro ridotto.
La formazione di Ac-CoA non fa parte del ciclo, ma può fungere da regolatore
attraveso un meccanismo di inibizione da prodotto (NADH e Ac-CoA) In presenza
di conc elevate di queste specie E2 rimane nella forma acetilata
9%
Riboflavin
CH;-0—P-0—P--0CH, 0,
KÒ
H-C-0H @ o
Ribitol ‘con
OH 0H J
H_C_-0H
Adenosine
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CoA
Adenosine-3'-
Il complesso della piruvato deidrogenasi Nucleo transacetilasico 3x8 Piruvato deidrogenasi (24) Diidrolipoil Deidrogenasi (12) Complesso enzimatico piruvato deidrogenasi
n NADT
SH
dibyelrotigoy] NADH + H'
MRS,
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co) CHx—C=TPP SH * le.
Hydroxyethyl- R $
TPP Lipoamide li
HS 7
pyruvate 2 dihydrolipoyl
dehydrogenase transacetylase HS.
(E) Ea]
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CH: C—C ve i 0
\ CH_-C—S |
cogne È CH3_C—S— CoA
Pyruvate HS Acetyl-CoA
R CoA
Acetyl-dibydrolipoamide
Citrato sintasi: una condensazione di Claisen
His 320
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H
7006 O
xv
CHy=C007
Oxaloacetate
+
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HC 4 SCOA
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2° -00C-HC ahi
Citryl-CoA H-0
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ù
CoASH
Doc x I
x
‘CH, —C007
Citrate
#
-00C—H;C
Citrato Sintasi
Siti di legame
per l'ossalacetato
e Modificazioni conformazionali in seguito al legame dell’ossalacetato
Ossalacetato |
fi Acetil CoA
-
His 274 | >
Nd
Complesso con il substrato
Citrato Sintasi
Intermedio enolico
Meccanismo della sintesi del CitrilCoA
Complesso con il citril CoA
CO COO. CO
| | |
CH, = CH, —__® CH
| | I
CH, CH? HC
| | |
C007 ,C007 ;C00°
Succinate Fumarate
H° 00”
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Cr 0H
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l 00c7 “, °
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Fumarate Malate
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N o + nad => ae No + NADH + H°
C:-0H C
007 Si “00c” No
Malate Oxaloacetate
Reazione Enzima AG" AG
1 citrato sintasi = -31,5 <0
2 aconitasi 5 0
3 Isocitrato DH = -21 <0
4 Glu DH -33 <0
5 SuccCoA sint -2.1 0
6 SuccCoADH +6 0
7 filmarasi -3,4 0
8 malato DH +29,7 0
Strategie di Regolazione
pre ST = Piruvato \
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OA NADH + H'
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Piruvato TARA Piruvato a /
deidrogenasi A! ‘0 . deidrogenasi , ale
1050, - 4 È - Acetil /_-
inattiva ADP Si ha attiva sat CoA /
x MR ic iucenze i ,
% ei
La via del gliossilato (piante, batteri) Carboidrati (cilco di Krebs, Gluconeogenesi) 2 AcetilCoA + NAD+ + 2H2O = succinato + 2 CoA + NADH + 2 H+ Acetato + CoA + ATP = AcetilCoA + AMP + PPi Glucosio
Piruvato
| Complesso
della piruvato
deidrogenasi
Acetil CoA
ri acotyL CoA ACP
o H_SCSA TT] transacyiase
W
—C—SCaA + H—SACF,
cA
)
t —SACP
trace
E
RIonyI- CoA e
ansacyvlas if
Za
H—SACP
BketoneyLACP
synthase
(condensing
enzyme)
3
CO: + H-S—E+-
o o
t_cH;—t-sace
Acetoncety-ACP
H + NADPII
BketoacyH-ACP reductase
NADE*
Ac-CoA è al centro calata
della sintesi degli acidi grassi dio GE
n0+È ) B-hydroxyaeylACP dehydrase
H o
Lu
—C_SACP
CHa-G
H
a,B-rrans-Butenoy-ACP
H* + NADPH
6] «noy-ACP reductaze
NADP+
f
CHg—CH3—CHs — C—SACP
ButyryLACP
recycle Reactions 2-6
i six more times
2
CH3CHz —(CHa)j:—C — SACP
PalmitoyLA CP
120) palmitoyi riioesterase
:Hs—(CHaha E —00 + H—SACP
Palmitate
Fosforilazione ossidativa
mo
‘2 Acetyl-Cx
fe —>
pregi — [om]
ere] —[eam]
